​ACERCA DEL CURSO

El Curso ofrece una formación práctica para comenzar en el análisis computacional de datos biológicos. Aprenderás a usar Linux para manejar archivos, acceder a bases de datos como NCBI, UniProt y PDB, programar en Python para trabajar con secuencias FASTA y aplicar librerías de Biopython para análisis bioinformáticos. Está dirigido a estudiantes y profesionales de biología, biotecnología, farmacología y áreas afines. Se recomienda tener nociones básicas de biología molecular y uso de computadora. Este curso es útil en investigación genómica, diseño de fármacos, biología estructural y docencia en bioinformática.

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1. Presentación del curso (exámen diagnóstico)

2. Introducción ambiente Linux

   1. Introducción a Linux

   2. Instalación de herramientas (virtualbox, etc) en tu computadora

   3. Entorno del sistema operativo

   4. Comandos básicos de navegación

   5. Manejo de herramientas de acceso remoto (Putty, etc)

   6. Edición de archivos con editores de texto en Linux

   7. Ejercicios de práctica

   8. Cuestionario de comprensión

3. Bases de datos (NCBI, UNIPROT y EBI)

   1. Selección y descarga de Secuencias biológicas

   2. Explorar base de datos PDB (archivos de texto)

   3. Explorar y conocer usos de BLAST

   4. Ejercicios de práctica

   5. Cuestionario de comprensión

4. Fundamentos programación con Python

   1. Variables

   2. Control de flujo (expresiones condicionales)

   3. Control de flujo (expresiones iterativas)

   4. Manejo de archivos

   5. Obtención de información de archivos fasta

   6. Ejercicios de práctica

   7. Cuestionario de comprensión

5. Biopython

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1.  Uso de librerías de BioPython Parte I

2. Uso de librerías de BioPython Parte II

3. Uso de librerías de BioPython Parte III

4. Uso de librerías de BioPython Parte IV   

5. Ejercicios de práctica

6. Cuestionario de comprensión

Nota: Se califica con actividades en plataforma google classroom (70%) y ejercicio final (30%), la constancia se entrega con calificación numérica de 1-10.

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