Curso de Linux y Python para Bioinformática
Duración: 6 semanas (15 horas)
Masterclass (webinar) GRATIS: PRÓXIMAMENTE
Registro: https://www.pharbiois.com/contacto
Inicio de curso: Inmediatamente
Validez oficial/curricular de la red SEP-CONOCER EC0301
Modalidad: Online: asincrónico: google classroom y/o https://pharbiois.milaulas.com/
Idioma: Español
TEMARIO
ACERCA DEL CURSO
Aprende a manejar el sistema operativo LINUX en tu computadora y/o de forma remota, además en este curso aprenderás PYTHON y BIOPYTHON aplicado al análisis de información biológica con enfoque BIOINFORMÁTICO, QUIMIOINFORMÁTICA, además para programar en R y PERL todo esto de la mano de informáticos expertos en la temática.
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Presentación del curso (exámen diagnóstico)
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Introducción ambiente Linux
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Introducción a Linux
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Instalación de herramientas (virtualbox, etc) en tu computadora
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Entorno del sistema operativo
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Comandos básicos de navegación
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Manejo de herramientas de acceso remoto (Putty, etc)
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Edición de archivos con editores de texto en Linux
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Ejercicios de práctica
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Cuestionario de comprensión
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Bases de datos (NCBI, UNIPROT y EBI)
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Selección y descarga de Secuencias biológicas
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Explorar base de datos PDB (archivos de texto)
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Explorar y conocer usos de BLAST
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Ejercicios de práctica
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Cuestionario de comprensión
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Fundamentos programación con Python
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Variables
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Control de flujo (expresiones condicionales)
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Control de flujo (expresiones iterativas)
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Manejo de archivos
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Obtención de información de archivos fasta
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Ejercicios de práctica
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Cuestionario de comprensión
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Biopython
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Uso de librerías de BioPython Parte I
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Uso de librerías de BioPython Parte II
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Uso de librerías de BioPython Parte III
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Uso de librerías de BioPython Parte IV
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Ejercicios de práctica
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Cuestionario de comprensión
Nota: Se califica con actividades en plataforma google classroom (70%) y ejercicio final (30%), la constancia se entrega con calificación numérica de 1-10.
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