Este curso te brindará los fundamentos de bioinformática estructural aplicada a proteínas, permitiéndote realizar prácticas en servidores en línea. Aprenderás a ejecutar y analizar estudios de docking proteína-proteína, tanto a nivel teórico como práctico, directamente desde tu computadora. Además, desarrollarás la capacidad de identificar y describir las interacciones no covalentes involucradas en el reconocimiento proteína-proteína, comprendiendo su importancia en procesos biológicos y en el diseño de nuevas estrategias terapéuticas.

TEMARIO

Unidad I: Introducción a Docking proteína-proteína: (3 horas) (teórico)

1. Introducción a Docking proteína-proteína.

2. Clasificación de metodologías de Docking proteína-proteína.

   1. Docking ciego

   2. Docking Dirigido

   3. Docking Flexible

3. ¿Qué tipo de método utilizar en la predicción de Docking proteína-proteína?

Unidad II: Técnicas de predicción de Docking de proteínas-proteínas: (6 horas) (práctico).

1. Docking proteína-proteína empleando los servidores

   1. HDOCK

   2. ClusPro

   3. FRODOCK 2.0

   4. SwarmDock

   5. HADDOCK

   6. PatchDock

   7. SymmDock

Unidad III: Evaluación y análisis de los Docking proteína-proteína: (3 horas) (práctico).

1. Evaluación y selección de los modelos predichos.

2. Análisis de la interfase entre las cadenas proteicas.

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