En este curso aprenderás a predecir sitios de fosforilación en proteínas utilizando herramientas computacionales como NetPhos, PhosphoSVM y PhosphoSitePlus, así como a visualizar los cambios estructurales que estos eventos postraduccionales inducen, empleando programas como PyMOL y SwissModel. Se requiere contar con conocimientos básicos en bioquímica y estructura de proteínas. Al finalizar, podrás analizar cómo la fosforilación afecta el reconocimiento molecular mediante estudios de docking proteína-proteína y proteína-ligando, con aplicaciones en investigación biomédica y diseño de fármacos.

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TEMARIO

TEMARIO

Unidad 1 – Conceptos básicos de fosfoproteómica

• Aminoácidos y proteínas

• Niveles estructurales de las proteínas

• Protein Data Bank

• Formato FASTA y .pdb

• Uniprot

• Swiss Model

• BlastP

• RMSD

• Mapa de Ramachandran

• ¿Qué es la fosforilación de proteínas?

• Importancia de la fosforilación

• Aminoácidos que se pueden fosforilar

• Cinasas y Fosfatasas

Unidad 2 – Predicción de fosforilación

• Introducción

• CRP

• NetPhos

• PhosphoSVM

• PhosphoSitePlus

• NetworKIN

Unidad 3 – Pymol

• Generalidades de Pymol

• Instalación

• Curso introductorio

• Funciones

Unidad 4 – Fosforilación

• Obtención de archivo .pdb y FASTA

• Evaluación de la homología

• Limpieza de la proteína

• Fosforilación

• Obtención de RMSD y Ramachandran

Unidad 5 – Influencia de fosforilaciones en los acoplamientos

• Docking proteína – proteína

• Docking proteína – ligando

Evaluación final del curso

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