Curso de Dinámica Molecular de Proteínas en Medio Acuoso
Validez oficial/curricular de la red SEP-CONOCER EC0301
Duración: 5 semanas (30 horas)
Masterclase GRATIS: 29 de MAYO del 2025
Registro: https://www.pharbiois.com/contacto
Inicio de curso: 17 de JUNIO del 2025 y acceso inmediato
Modalidad: online asincrónico en https://pharbiois.milaulas.com
Idioma: Español
Profesor: Dr José Correa Basurto,
Formación: Medicina, Maestría en Farmacología, Master en Bioinformática, D en C en Investigación en Medicina, Investigador SNII-3
Productividad: 240+ artículos científicos, 8+ patentes
acerca del curso
Curso dirigido a estudiantes, investigadores y empresas farmacéuticas con conocimientos básicos en biología molecular, estructura de proteínas y manejo de computadora. Aprenderás a ejecutar simulaciones de dinámica molecular con NAMD, VMD y CARMA, interpretarás métricas como RMSD y RMSF. Aplicarás estos conocimientos en investigación biomédica, diseño racional de fármacos y biotecnología estructural.
TEMARIO
1. Presentación.
2. Estructura de proteínas.
3. Aplicación de dinámica molecular (DM) en el área farmaceútica.
4. Aplicación de DM en el área biotecnológica.
5. Generalidades sobre Campos de Fuerza (force fields).
6. Conceptos, (RMSD, RMSF, Rg, superficies accesibles a solvente, cambios conformacionales).
7. Ejercicios de visualización con VMD.
8. Archivos requeridos para una DM.
9. Preparación de archivos para correr DM.
10. Minimización de estructura para DM.
11. Simulación de DM en NAMD.
12. Continuación de simulación de DM en NAMD.
13. Análisis de resultados por VMD.
14. Análisis de resultados por CARMA.
15. Continuación de análisis de resultados por CARMA.
16.- Actividad final: realizar ejercicio de dinámica molecular usando proteína de su interés
Nota: Se califica con actividades en rcampùs.com (70%) y ejercicio final (30%), la constancia se entrega con calificación numérica de 1-10.
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